計算機軟件的程序代碼為機器語言，由于不能為人們直接讀取與理解，所以計算機軟件的程序代碼本身是不能申請zhuanli的，需要將其轉(zhuǎn)換為自然語言。在計算機軟件開發(fā)的過程中，通常需要首先確定該軟件的流程圖，而流程圖往往是以步驟性表述呈現(xiàn)的。例如，第一步，接收X信號；第二步，對X信號進行處理，生成Y信號；第三步……。因此，在對計算機軟件進行zhuanli挖掘時，軟件開發(fā)企業(yè)可將類似上述的流程圖及相應(yīng)文字性說明材料提供給合作的zhuanli代理機構(gòu)。

zhuanli申請代理機構(gòu)會基于上述材料撰寫完成包括流程步驟形式的軟件方法保護范圍，即，方法權(quán)利要求的zhuanli申請文件。這樣不僅可以保護以C語言編寫的該計算機程序，也能保護以Java語言和其他任何計算機語言所編寫的具有相同邏輯思想的軟件，使軟件開發(fā)者的保護權(quán)益最大化。

作為zhuanli代理機構(gòu)，在處理基于計算機軟件的發(fā)明zhuanli申請時，需要考慮到日后的侵權(quán)與維權(quán)問題。雖然zhuanli權(quán)在一定程度上比軟件著作權(quán)更易維權(quán)，但作為方法類的zhuanli，如果僅對方法本身進行保護，由于方法的虛擬性，在調(diào)查取證的過程中，依然會存在很多困難，不利于zhuanli權(quán)人進行維權(quán)。

因此，從zhuanli保護的全面性與維權(quán)取證的便利性角度出發(fā)，在一個基于計算機程序的發(fā)明zhuanli申請中，應(yīng)該至少包括方法權(quán)利要求和實體裝置權(quán)利要求，以分別保護例如具有特定思想的非實體的軟件，以及安裝有上述軟件的實體的手機等裝置?？蛇x地，還應(yīng)包括虛擬裝置權(quán)利要求和存儲介質(zhì)權(quán)利要求等。

企業(yè)也可以從上述幾個方面評價zhuanli代理機構(gòu)的專業(yè)程度，以選擇最合適的zhuanli代理機構(gòu)進行合作。

綜上所述，企業(yè)在尋求對所開發(fā)的計算機軟件進行知識產(chǎn)權(quán)保護時，可以根據(jù)軟件創(chuàng)新點所在以及維權(quán)需求等因素進行計算機軟件著作權(quán)、外觀設(shè)計zhuanli和發(fā)明zhuanli等方面的保護，在尋找合作的zhuanli代理機構(gòu)時，可以根據(jù)其專業(yè)程度以及其他商業(yè)因素對其進行評估。